거대한 지하 도시로부터 시작된 전설 그 신비한 비밀을 밝히기 위한 모험이 시작된다.

소녀 아스나는 어느 날 아버지의 유품인 광석 라디오를 통해 듣게 된 신비한 음악에 매료된다. 하지만 다시 그 음악을 듣기 위해 자신만의 비밀 장소로 향하던 길에 괴물의 습격을 받게 된다. 그리고 슈운이라는 소년이 나타나 아스나를 구해준다. 아가르타라는 먼 곳에서 왔다는 슈운에게 두근거리는 감정을 갖게 된 아스나는 그를 만나기 위해 약속 장소로 다시 가지만 슈운은 나타나지 않는다. 슬퍼하던 아스나는 신임 교사 모리사키로부터 지하세계의 신화에 대해 듣게 되고 그것이 슈운과 관련이 있음을 직감한다. 그리고 슈운과 꼭 닮은 신과 그를 쫓는 비밀 조직 아크엔젤의 추격전에 휘말리게 된다. 소년 신은 아스나를 뒤로 하고 지하세계로 자취를 감추고 아스나는 모리사키에게 아가르타로의 모험에 동참하겠다고 말한다.

‘아르가타’라는 원시 세계와 오르페우스 신화를 적절히 섞어가며 생명에 대한 근원적인 통찰을 담고 있다.

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